Налоговый учет имеет на этот счет ограничения
Потери "сверх норм естественной убыли и боя" не могут быть учтены в целях налогообложения прибыли. Потому в расходах допускается учитывать только потери от недостачи или порчи при хранении и транспортировке в пределах норм естественной убыли, утвержденных в установленном Правительством РФ порядке.
С другой стороны, внереализационными расходами являются недостачи материальных ценностей в производстве, на складах, в торговле в случае отсутствия виновных лиц, а также убытки от хищений, виновники которых не установлены. Но факт отсутствия виновных лиц должен быть документально подтвержден уполномоченным органом власти, что вряд ли возможно в отношении, к примеру, товара в магазине самообслуживания (
Письмо Минфина от 28 апреля 2010 г. N 03-03-06/1/300).
Российский налоговый портал.